云序用户案例

案例1：NAT10对mRNA中胞苷的N4-乙酰化修饰在T细胞扩增和抗病毒免疫中的关键作用

原文：A critical role ofN4-acetylation of cytidine in mRNA by NAT10 in T cell expansion and antiviral immunity

发表时间：2025/03/05

发表期刊：Nature Immunology                       

影响因子：27.7

发表单位：复旦大学医学院附属中山医院&金山医院

 

据报道，ac4C的“writer”蛋白N-acetyltransferase 10 (NAT10)，以及ac4C在维持mRNA稳定性和促进翻译效能方面有重要生物学功能。NAT10介导的ac4C修饰在多种疾病和病症中的潜在作用，如早衰、自身免疫性疾病、感染、炎症和癌症等。该研究探究了NAT10蛋白影响MYC蛋白水平的机制，通过ac4C-RIP-seq分析显示ac4C峰广泛分布在Myc mRNA区域内，并且这些峰在Nat 10缺失后均显着下调。ac4C-RIP-qPCR进一步证实Myc mRNA被ac4C修饰，借助RIP-qPCR也证明了NAT10蛋白与Myc mRNA特异性结合。这些结果表明，NAT10通过ac4C RNA修饰动态调控Myc mRNA的稳定性与翻译效率。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

  图1. 验证NAT10蛋白与Myc mRNA特异性结合

 

 

案例2：N-乙酰基转移酶10通过N4-乙酰胞苷修饰SLC30A9调节AMPK/mTOR信号，促进生成弥漫性大B细胞淋巴瘤

原文：N-acetyltransferase 10 facilitates tumorigenesis of diffuse large B-cell lymphoma by regulating AMPK/mTOR signalling through N4-acetylcytidine modification of SLC30A9

发表时间：2024/07/03

发表期刊：Clinical And Translational Medicine                       

影响因子：7.9

发表单位：山东省立医院

 

弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）是一种表型和分子特征高度不均匀的淋巴瘤，它也是最常见的侵袭性非霍奇金淋巴瘤（NHL）类型。研究表明，针对表观遗传多样性提供了广泛调节肿瘤细胞转录活性的可能性，并可能在治疗DLBCL中起作用。由N-乙基转移酶10（NAT 10）催化的N4-乙基胞苷（ac 4C）修饰是一种新型化学修饰，可提高翻译效率和mRNA稳定性。该研究通过RIP-qPCR表明NAT10蛋白与SLC30A9 mRNA存在显著的结合和相互作用，NAT10似乎在调节DLBCL中SLC30A9 mRNA乙酰化方面发挥重要作用。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

图2. NAT10蛋白与SLC30A9 mRNA存在显著的互作关系

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

云序优势

1. 一站式服务

客户只需提供细胞或组织，云序生物为您完成从实验设计→样本处理→RIP→qPCR→数据分析整套服务流程。

2. 商业化的RIP试剂盒

RIP实验的成败是决定数据质量的关键，云序生物采用商业化RIP试剂盒，保证了RIP实验的成功率和稳定性。

3. 严格的质控

云序生物在实验的各个关键步骤加入了一系列质控点，全程监控实验质量，确保客户得到优质的数据。

4. 精准数据分析

云序生物采用Fold Enrichment进行定量分析，并使用IgG阴性对照，确保结果可靠。

 

 

云序数据分析（仅供展示 详见demo报告）

1.具体基因的qPCR

基因1 PDE3A的RIP-qPCR结果如下表所示。（示例）

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2.扩增曲线

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3.熔解曲线

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样本要求：

样品类型：

细胞或组织。其它类型样品请详询。

样品量：

1)细胞：5×10^8

2)组织：500 mg

样品运输及保存：

样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。

样品保存：细胞样品或新鲜组织块液氮冻存后-80℃保存。