-
-
- 单碱基m6A RNA修饰测序（GLORI）
- 单碱基m5C RNA修饰测序（Bis-Seq）
- 单碱基m1A RNA修饰测序（m1A-MAP-Seq）
- 单碱基ac4C RNA修饰测序（Reda C:T-Seq）
- 单碱基m7G RNA修饰测序（Alkaniline-Seq）
- 单碱基m7G修饰tRNA测序（TRAC-Seq）
- 单碱基2’-O甲基化修饰测序（NM-Seq）
- 单碱基O8G RNA修饰测序（O8G miSeq）
- 单碱基假尿嘧啶RNA修饰测序（BID-Seq）
- 糖基化RNA测序（GlycoRNA-Seq）
- m6Am RNA修饰测序（m6Am-Exo-Seq）
- m6A RNA修饰测序（m6A MeRIP-Seq）
- m5C RNA修饰测序（m5C MeRIP-Seq）
- m1A RNA修饰测序（m1A MeRIP-Seq）
- ac4C RNA修饰测序（acRIP-Seq）
- m7G RNA修饰测序（m7G MeRIP-Seq）
- 5hmC RNA修饰测序（hMeRIP-Seq）
- O8G RNA修饰测序（O8G-RIP-Seq）
- 假尿嘧啶RNA修饰测序（Ψ-RIP-Seq）
-
云序课堂二维码
云序生物二维码
-
Dual RNA-Seq技术
技术简介
Dual RNA-Seq 互作转录组测序是一种新兴技术，用于分析细菌病原体感染哺乳动物细胞的基因表达变化。与传统方法不同，可同时检测宿主（如人类、动植物）和病原体（如病毒、细菌、真菌、寄生虫等）在共同微环境中的基因表达谱，从而系统解析宿主与病原体之间的动态互作关系。Dual RNA-Seq 主要特征在于构建一个文库可同时研究两个及其以上物种，并将测序数据分别比对到宿主基因组和病原体基因组，可实现同时对宿主和病原体的测序和分析。该技术突破了传统转录组学仅单一分析宿主或病原体的局限，并实现在细菌感染模型中的各种新兴应用，包括细菌基因活性与特定宿主反应的直接关联，以及鉴定在标准毒力测定中不可见的病原体基因的“分子表型”。
DualRNA-seq与传统RNA-seq流程图
云序生物Dual RNA-Seq 的技术原理是从包含宿主与病原体的同一样本（如感染组织、细胞共培养体系）中提取总 RNA，去除核糖体 RNA（rRNA）后进行高通量测序；将获得的测序数据分别比对至宿主基因组和病原体基因组，分离并定量双方的转录本，识别差异表达基因，结合 GO、KEGG 通路富集及共表达网络分析等方法，挖掘宿主与病原体互作过程中的关键基因、信号通路及调控机制，也可以通过比较基因组学来研究病原体野生型和突变型的差异。
Dual RNA-seq实验及数据分析流程
-
ꁸ 回到顶部
-
ꂅ 021-64878766
-
ꁗ QQ客服
-
ꀥ 微信公众号二维码
-
-
案例展示
HECTD3 在细菌感染期间介导 TRAF3 多泛素化和 I 型干扰素诱导
原文：HECTD3 mediates TRAF3 polyubiquitination and type I interferon induction during bacterial infection
期刊：J Clin Invest 影响因子 19.5
TRAF3 的赖氨酸 63 连接 （K63 连接） 多泛素化协调模式识别受体与诱导 I 型 IFN 的通路中募集的接头蛋白和下游激活剂 TBK1 的结合。自身泛素化或其他 E3 连接酶是否介导 K63 连接的 TRAF3 多泛素化仍不清楚。我们通过RNA-seq（Dual RNA-seq）证明，缺乏 E3 连接酶基因 Hectd3 的小鼠通过限制细菌传播，显着提高了宿主对细胞内细菌 Francisella novicida、分枝杆菌和李斯特菌感染的防御能力。在没有 HECTD3 的情况下，I 型 IFN 反应在体内和体外细菌感染期间都受损。HECTD3 通过介导 TRAF3 在残基 K138 处的 K63 连接多泛素化来调节 I 型 IFN 的产生。HECTD3 的催化结构域调节 TRAF3 K63 多泛素化，从而使 TRAF3-TBK1 复合物形成。我们的研究提供了对 TRAF3 调节机制的见解，并提供了针对细胞内细菌感染和炎症性疾病的潜在治疗靶点。
-
云序优势
全面高效：
单样本高通量全面检测互作物种转录本，揭示基因表达及动态变化。
一站式服务：
客户只需提供组织、细胞或RNA，云序生物为您完成Dual RNA-seq全套实验服务。
专业的生物信息学分析：
云序生物拥有专业的生物信息分析团队，助力客户个性化挖掘实验数据。
-
技术服务
Technical Service
-
RNA修饰组测序
ꁕ
- 单碱基m6A RNA修饰测序（GLORI）
- 单碱基m5C RNA修饰测序（Bis-Seq）
- 单碱基m1A RNA修饰测序（m1A-MAP-Seq）
- 单碱基ac4C RNA修饰测序（Reda C:T-Seq）
- 单碱基m7G RNA修饰测序（Alkaniline-Seq）
- 单碱基m7G修饰tRNA测序（TRAC-Seq）
- 单碱基2’-O甲基化修饰测序（NM-Seq）
- 单碱基O8G RNA修饰测序（O8G miSeq）
- 单碱基假尿嘧啶RNA修饰测序（BID-Seq）
- 糖基化RNA测序（GlycoRNA-Seq）
- m6Am RNA修饰测序（m6Am-Exo-Seq）
- m6A RNA修饰测序（m6A MeRIP-Seq）
- m5C RNA修饰测序（m5C MeRIP-Seq）
- m1A RNA修饰测序（m1A MeRIP-Seq）
- ac4C RNA修饰测序（acRIP-Seq）
- m7G RNA修饰测序（m7G MeRIP-Seq）
- 5hmC RNA修饰测序（hMeRIP-Seq）
- O8G RNA修饰测序（O8G-RIP-Seq）
- 假尿嘧啶RNA修饰测序（Ψ-RIP-Seq）
- DNA修饰组 ꁕ
- 表观基因组 ꁕ
- 转录调控组和翻译组 ꁕ
- 分子互作组 ꁕ
- 转录组 ꁕ
- 单细胞测序与空间组学 ꁕ
- 基因组 ꁕ
- 定量PCR服务 ꁕ
关于我们
云序生物聚焦科研前沿领域，是国内率先开展RNA修饰，转录组及eccDNA研究的创新性企业，提供各类RNA修饰，各类RNA分子，各类测序技术及eccDNA系统性解决方案，参与的研究成果在各大国际顶级期刊发表数百篇，影响因子累积10000+。
官网QQ
云序课堂二维码
云序生物二维码
关注我们
