案例分析

案例1：通过血清中特定microRNA的表达特征预测非小细胞肺ai患者生存期长短

原文：Serum microRNA signatures identified in a genome-wide serum microRNA expression profiling predict survival of non-small-cell lung cancer

期刊：Journal Of Clinical Oncology 影响因子：26.30
作者通过microRNA高通量测序对两组生存期不同的非小细胞肺ai患者的血清样品进行检测，发现了11个差异表达的microRNA。通过实时定量PCR进一步验证，找出了4个与生存期长短相关的microRNA。通过生物信息学分析，根据这4个microRNA在训练样品组中的表达情况构建了一个预测模型。基于这个模型，只需检测血清中这4个microRNA的表达值，就可以推断出罹患非小细胞肺ai的风险，并预测生存期长短。

图1. 303个早期非小细胞肺ai患者的风险值分析

（A）风险值分布；（B）患者的生存状况和生存时间；（C）4个关键microRNA在非小细胞ai患者中的表达情况

云序技术优势：

一站式服务：
客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA，云序生物为您完成从样品准备，文库制备，上机测序到数据分析的整套服务流程。

特异性富集miRNA片段：
特异性富集和检测miRNA，miRNA有效数据比例高于其它公司提供的常规small RNA测序服务。

专业的生物信息学分析：
云序生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析要求。

数据分析（下列有※表示个性化分析）

1、差异miRNA筛选与聚 类筛选 

两组或多组样品间的差异表达miRNA（Fold Change≥2， P值≤ 0.05）。

注：Fold Change代 表差异程度，P值代 表差异的明显性，筛选中采用的倍数变化会根据具体数据情况进行调整 。

2、miRNA靶基因预测※

云序生物整合了TargetScan、mirBase、miRanda等权威miRNA靶基因预测软件，提供极严谨可靠的靶基因预测数据，通过软件预测miRNA的靶基因，从而推测miRNA的生物学功能。

3、miRNA靶基因网络

构建miRNA靶基因网络。

4、miRNA靶基因GO和信号通路分析

对miRNA的靶基因进行GO和信号通路分析，从而帮助推断miRNA的生物学功能。

5、miRNA-靶基因GO或靶基因通路网络分析※ 

利用miRNA靶基因及靶基因GO或信号通路分析，构建网络图，通过网络图可发现核 心miRNA以及miRNA调控的核 心基因功能。

6、miRNA上游转录因子分析※ 

预测特定miRNA上游的转录因子结合位点，帮助推断该miRNA的调控机制。

7、新miRNA预测（脊椎动物） 

预测尚未被发现的新miRNA。