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O8G RNA修饰测序（O8G-RIP-Seq）技术
O8G-IP-seq 产品列表：
技术简介：
O8G RNA氧化修饰是在哺乳动物细胞内活性氧攻击mRNA中的鸟嘌呤从而产生的一种RNA修饰，它可以与腺嘌呤配对并诱导鸟嘌呤-胸腺嘧啶（G> T）突变，是病理生理学中一种通过活性氧氧化导致疾病表型的修饰。目前，O8G RNA氧化修饰作为一类新型RNA修饰，是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”！
云序生物对O8G RNA氧化检测手段为O8G-IP-Seq技术，RNA免疫沉淀结合下一代测序（O8G-IP-Seq）是在全基因组规模上检测O8G RNA氧化修饰并研究其作用机制的一种高效且经济的方法。技术原理如下： 将O8G特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育，抓取有O8G修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本只含有打断的RNA片段，并不添加O8G特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的O8G片段的背景。对比免疫共沉淀（IP）样本和对照样本（Input）中的序列片段，将O8G氧化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中O8G氧化程度及对RNA表达水平的影响。
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案例分析
案例1：O8G RNA氧化修饰与蛋白翻译密切相关
原文：Position-specific oxidation of miR-1 encodes cardiac hypertrophy
期刊：Nature 影响因子： 64.8
韩国高丽大学Sung Wook团队在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的microRNA（miRNA）进行了特异性测序。结果发现8-氧代鸟嘌呤2（O8G）修饰是选择性地在miRNA的特殊区域（位置2-8）产生的，并通过O8G-A碱基互补配对来调节其他mRNA。用肾上腺素能激动剂治疗后主要在miR-1（7O8G-miR-1）的第7位诱导了O8G氧化修饰。单独引入的7O8G-miR-1或7U-miR-1（其中7位的G被U取代）足以引起小鼠心脏肥大，O8G-miR-1的mRNA靶基因在受影响的表型中起作用，反之对小鼠心肌细胞7O8G-miR-1的特异性抑制可减轻心脏肥大。O8G-miR-1也与心肌病患者有关。本研究表明miRNA的位置特异性氧化可以作为表观转录机制来协调病理生理学氧化还原介导的基因表达，为研究氧化修饰在病理生理学中的作用提供了新的思路。
miR-1位置特异性氧化的示意图模型
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云序技术优势：
最全产品线：可针对性地检测不同类型RNA分子的O8G氧化；
特异性高：特异性富集和检测O8G氧化的 RNA片段；
全转录组覆盖：全转录组范围的RNA O8G氧化检测；
全物种检测：可以检测几乎任何动植物的O8G氧化；
专业化的生信分析：强大的生信团队，专业的O8G氧化数据分析；数据分析
1.差异氧化区域的GO分析与KEGG信号通路分析
2.RNA氧化修饰位点Motif分析及peak韦恩图
3.差异RNA氧化区域的识别与聚类
4.氧化修饰富集峰在基因上的分布
5.个性化分析
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技术服务
Technical Service
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RNA修饰组测序
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云序生物聚焦科研前沿领域，是国内率先开展RNA修饰，转录组及eccDNA研究的创新性企业，提供各类RNA修饰，各类RNA分子，各类测序技术及eccDNA系统性解决方案，参与的研究成果在各大国际顶级期刊发表数百篇，影响因子累积10000+。
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