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ac4C RNA修饰测序（acRIP-Seq）技术
技术简介：
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰（N4-acetylcytidine）。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，导致Watson-Crick碱基配合鸟苷的热稳定性增加，调控蛋白合成中的编码准确性；近期研究发现ac4C广泛分布在人类转录组中，大多数位点出现在编码序列（CDS）内，并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前，ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰，是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”！
与MeRIP-seq类似，acRIP-seq是针对ac4C RNA乙酰化修饰的免疫沉淀与高通量测序结合的技术，是在全基因组规模上检测RNA乙酰化修饰并研究其作用机制的一种高效且经济的方法。技术原理如下： 将乙酰化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育，抓取有乙酰化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本只含有打断的RNA片段，并不添加RNA乙酰化特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的乙酰化片段的背景。对比免疫共沉淀（IP）样本和对照样本（Input）中的序列片段，将RNA乙酰化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中RNA乙酰化程度及对RNA表达水平的影响。
ac4c acRIP-Seq 产品列表：
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案例分析
案例1：mRNA中胞嘧啶核苷乙酰化促进其翻译效率
原文：Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency
期刊：Cell 影响因子：64.5
美国国家癌症研究所（NCI）和弗雷德里克国家实验室，发现下调NAT10（RNA去乙酰化酶）能够抑制Hela细胞的行为；并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修饰，下调NAT10后，ac4C的总体水平下降；为了进一步探究ac4C的功能，作者对WT和下调NAT10的Hela细胞进行acRIP-seq和mRNA测序，发现ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS区，同时下调NAT10能够降低ac4C在mRNA中的定点表达，并与靶mRNA的下调有很大关系；作者又进一步发现ac4C乙酰化修饰能够通过延长mRNA的半衰期并促进mRNA的稳定性，同时也能够通过ac4C peak中的密码子偏好性表达，决定并影响mRNA的解码效率，促进底物翻译。这些发现不仅扩大了mRNA修饰范围（包括乙酰化残基），也确立了ac4C在mRNA翻译调控中的作用。
图注：ac4C的结构及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情况
图注：ac4C延长mRNA的半衰期，提高其稳定性
图注：ac4C促进mRNA的翻译效率
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云序技术优势：
一站式服务：
客户只需提供组织、细胞、全血样品或RNA，云序生物为您完成m5C BS-Seq全套实验服务。
抗体富集效率高：
acRIP-seq的富集效率是决定数据质量的关键，云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化试剂盒和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。
严格的质控：
云序生物对acRIP-seq实验每一步骤均设有关键质控，全程监控实验质量，保证客户得到优质数据。
专业的生物信息学分析：云序生物拥有专业的生物信息分析团队，帮助客户进行实验数据的全面挖掘。
RNA乙酰化测序与转录组联合应用：
可整合RNA乙酰化数据和转录组数据进行生物信息学关联分析，揭示RNA乙酰化对基因表达调控的影响，深入挖掘RNA乙酰化的功能。
数据分析（下列有※表示个性化分析）
1.差异乙酰化区的GO分析与KEGG信号通路分析
2.RNA乙酰化位点Motif分析和peak韦恩图
3.差异RNA乙酰化聚类图、火山图、散点图
4.乙酰化富集峰在基因上的分布
5.染色体差异基因数统计※
6.修饰峰染色体分布图※
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技术服务
Technical Service
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RNA修饰组测序
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云序生物聚焦科研前沿领域，是国内率先开展RNA修饰，转录组及eccDNA研究的创新性企业，提供各类RNA修饰，各类RNA分子，各类测序技术及eccDNA系统性解决方案，参与的研究成果在各大国际顶级期刊发表数百篇，影响因子累积10000+。
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