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云序生物m5C RNA甲基化测序
日期:2018年02月28日    来源:云序生物

m5C RNA甲基化简介

通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为明显。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊。



图: RNA甲基化历年发文章数据

RNA甲基化是一类新认知的表观遗传修饰,主要包括6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A), 5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine,m5C),1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenosine,m1A)等。RNA甲基化在调控基因表达、稳定、降解等方面具有重要作用。其中,m5C RNA甲基化是一类新型的表观转录组学修饰,也是的国际科研热点,在非编码RNA及部分mRNA上存在。为了系统性揭示RNA甲基化修饰,云序生物m5C RNA甲基化测序服务,可在全转录组范围内单碱基分辨率地检测基因m5C甲基化修饰分布。

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m5C RNA甲基化文献解析(影响因子:11.9)

这里给大家分享一篇2017年《Genome Biology》上的m5C甲基化谱文章:作者通过m5C RNA甲基化测序,发现小鼠胚胎干细胞中m5C修饰位点优先分布于mRNA起始密码子附近,在小鼠脑组织中则倾向于分布在3'UTR区。通过生信分析对m5C修饰的RNA对应基因功能GO注释。此外与CLIPdb的数据联合分析发现,小鼠胚胎干细胞中大约29%的m5C RNA修饰位点与对应RBP(RNA结合蛋白)结合位点重合,显示出与RBP结合并在特定转录本中发挥生物学功能的潜力。

思路图

结果展示



胚胎干细胞和大脑组织中m5C RNA甲基化富集区域注释

云序生物m5C RNA甲基化数据展示

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