欢迎进入上海云序生物科技有限公司官方网站!   生物在线    丁香通

服务热线 021-64878766

首页 > 新闻动态 > 行业新闻

9-12月m6A*新高分文章汇总
日期:2021年12月16日    来源:
m6A修饰是一种可逆的RNA修饰类型,也是目前RNA中研究*清楚的一种修饰方式。有关RNA m6A修饰*早的研究报道在1974年,随后在各物种中被发现,m6A修饰几乎在所有RNA代谢过程中发挥重要作用。目前针对m6A RNA甲基化的研究仍然如火如荼。
近几月,有关m6A RNA甲基化修饰的高分文章依旧层出不穷,多篇文章报道了m6A在各个研究方向的机制。那么有哪些具体的进展?有哪些新的方法思路?小编汇集了9月至今这三个多月的多篇m6A RNA修饰高分文章,带大家把握这一领域的*新进展。
m6a高分文章汇总

m6A近期高分文章汇总
 
高分文章展示

1. m6A介导干扰素信号传导和抗原呈递
发表期刊:Cancer Discovery
影响因子:39.397
发表时间:2021.10.08
文章链接:Transcription Elongation Machinery Is a Druggable Dependency and Potentiates Immunotherapy in Glioblastoma Stem Cells
胶质母细胞瘤(GBM)是*具侵袭性和致命性的人类*症之一,由GBM干细胞(GSCs)促进。受遗传和表观遗传改变驱动的GSC有助于*瘤的持续生长、侵入正常大脑、逃避免疫监视和zhi疗抵抗,因此是GBMzhi疗的关键靶标。本文研究人员在大量患者来源的GSC、分化的胶质母细胞瘤细胞(DGC)和神经干细胞(NSC)中探究基因表达和全基因组CRISPR/Cas9筛选,以确定 GSC 干性的主要调节因子,揭示基本的转录状态随着 RNA 聚合酶 II 介导的转录增加。发现YY1 和转录 CDK9 复合物对于体外和体内 GSC 的存活和维持至关重要,可调节 GSC 中的转录延伸,并靶向引发 RNA m6A 修饰依赖性干扰素反应,减少调节性 T 细胞浸润,并增强免疫检查点zhi疗在胶质母细胞瘤中的疗效。总的来说,YY1-CDK9 转录延伸复合物定义了一种可靶向的细胞状态,在胶质母细胞瘤中具有活跃的转录、抑制的干扰素反应和免疫zhi疗抗性。
图例:YY1-CDK9复合物通过调节RNA 聚合酶 II介导的转录延伸和RNA m6A修饰
图例:YY1-CDK9复合物通过调节RNA 聚合酶 II介导的转录延伸和RNA m6A修饰
 
2. 对RNA修饰测序进行系统校准的方法
发表期刊:Nature Methods
影响因子:28.547
发表时间:2021.09.30
文章链接:Systematic calibration of epitranscriptomic maps using a synthetic modification-free RNA library
在转录组中普遍存在的RNA修饰的发现导致了表观转录组学领域的快速发展。近年来,研究人员们设计了多种方法来揭示不同RNA修饰的表观转录组图谱。但是在实际应用中,效果差强人意,经常存在高假阳性率、低分辨率的问题。不同研究方法下,同一种修饰的位点数甚至能相差2-3个数量级。因此,需要开发一种充分可靠的方法,作为评估表观转录图谱的标准。因此,中山大学的骆观正教授团队提出了一种体外构建全转录组无修饰RNA(IVT RNA)文库的方法,系统地对常用的RNA修饰检测方法进行评估和校正,提高了修饰位点检测的准确性,从而获得高置信度位点信息和定量图谱。
图例:IVT RNA文库校正MeRIP-seq/m6A-seq
图例:IVT RNA文库校正MeRIP-seq/m6A-seq
 
3. m6A-seq2方法实现m6A定量分析
发表期刊:Nature Methods
影响因子:28.547
发表时间:2021.09.03
文章链接:Multiplexed profiling facilitates robust m6A quantification at site, gene and sample resolution
常用的基于抗体识别m6A的鉴定RNA m6A修饰位点的m6A-seq法,存在一些明显的缺点:(1)RNA用量大;(2)生物学重复差;(3)无法进行样本和基因层面的定量分析;(4)实验成本高。基于这些不足,研究人员针对其进行优化升级,开发了m6A-seq2:对不同样本进行标签化——通过对不同样本连接特异性的接头,混合后进行抗体识别与免疫沉淀与建库,**降低每个样本RNA的用量,并且由于是同时进行免疫沉淀和建库,生物学重复性也会明显提高,同时也会**降低实验成本。
图例:m6A-seq与m6A-seq2实验方法的示意图比较
图例:m6A-seq与m6A-seq2实验方法的示意图比较
 
4. IGF2BP维持造血干细胞功能
发表期刊:Cell Stem Cell
影响因子:24.633
发表时间:2021.10.21
文章链接:Differential m6A RNA landscapes across hematopoiesis reveal a role for IGF2BP2 in preserving hematopoietic stem cell function
m6A是mRNA上*丰富的修饰,在各种生物过程中起着关键作用,一些m6A调节因子在正常和恶性造血过程中起关键作用,调节星状细胞命运。因此,建立RNA m6A修饰的全mian景观,解读其在不同生理和病理背景下的动态和作用至关重要。然而由于稀少细胞的技术限制,造血系统中的m6A景观仍是未知状态。因此,研究人员开发了一种针对稀少的造血干细胞的高度敏感和高效的zhong共输入m6A测序(SLIM-seq)策略,建立了一个跨造血层次的全mianm6A景观,并发现IGF2BP2是通过调节线粒体活性维持星状细胞功能的关键因子。
图例:造血系统m6A景观及IGF2BP2作用机制
图例:造血系统m6A景观及IGF2BP2作用机制
 
5.  FTO缓解心功能障碍
发表期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy
影响因子:18.187
发表时间:2021.11.02
文章链接:m6A demethylase FTO attenuates cardiac dysfunction by regulating glucose uptake and glycolysis in mice with pressure overload-induced heart failure
m6A参与多种生物过程和疾病,是哺乳动物mRNA*常见的转录后修饰。然而它在心力衰竭(HF)期间心脏功能代谢变化中的作用尚不清楚。为此,研究人员探究了m6A去甲基化酶基因 FTO 在压力过载诱导的心衰期间的代谢中的作用。该研究jing准报道了该基因在心脏功能发挥和结构重塑中的关键功能,特别是作用于葡萄糖代谢途径,揭示了m6A修饰在 HF 期间心脏代谢稳态中作用,表明 FTO 有潜力成为 HF 预防和zhi疗靶点。
图例:FTO调节葡萄糖摄取和糖酵解的模型
图例:FTO调节葡萄糖摄取和糖酵解的模型
 
6. m6A促进阿尔兹海默症发展
发表期刊:Molecular Cell
影响因子:17.970
发表时间:2021.10.21
文章链接:Interaction of tau with HNRNPA2B1 and N6-methyladenosine RNA mediates the progression of tauopathy
微管相关蛋白tau在健康状态下能够稳定微管,但是在压力和疾病下,如阿尔兹海默症(AD),会发生寡聚、磷酸化,在躯体树突枝中积累。Tau蛋白在应激和疾病状态下的生物学功能仍是未知状态。研究人员发现tau蛋白的低聚化会招募RNA结合蛋白和m6A修饰的RNA转录本,称为N6-甲基腺苷RNA。这种复合物调节应激反应并抑制蛋白质的合成。在AD及其相关模型中,这种复合物变得持续化和病理化,导致tau蛋白纤维化、核膜破坏和进行性神经衰退性变。HNRNPA2B1下调可降低对病理tau蛋白的反应。m6A随着人类AD大脑中疾病的严重程度逐渐增加。
图例:m6A与寡聚tau蛋白在人AD脑组织first定位
图例:m6A与寡聚tau蛋白在人AD脑组织first定位
 
7. m6A reader IMP2或发挥促结直肠*作用
发表期刊:Journal of Hematology and Oncology
影响因子:17.388
发表时间:2021.11.07
文章链接:N6-methyladenosine reader IMP2 stabilizes the ZFAS1/OLA1 axis and activates the Warburg efect: implication in colorectal cancer
越来越多的证据表明m6A调节器参与到结直肠*(CRC)的病因学和进展,但是m6A reader参与糖酵解代谢的确切机制尚未清楚。本文研究人员发现,在CRC中,lncRNA ZFAS1的RGGAC/RRACH元件的+843腺苷位点发生m6A修饰,IMP2与其直接互作,促进ZFS1的RNA稳定,在CRC增殖和进展过程中增加OLA1的招募、ATP的水解以及糖酵解。IMP2和ZFAS1在CRC细胞和配对CRC队列中明显过表达,m6A水平升高(n=144),这些指标可以是CRC预后预测的chao低生物标志物。IMP2调控ZFAS1表达,增强CRC细胞增殖、集落形成和凋亡抑制,具有致*作用。
图例:IMP2稳定的ZFAS1通过促进OLA1的ATP酶活性来促进结直肠*进展
图例:IMP2稳定的ZFAS1通过促进OLA1的ATP酶活性来促进结直肠*进展
 
云序生物m6A修饰研究五大模块

01 m6A RNA修饰测序
m6A RNA修饰测序(m6A-meRIP-seq)
对m6A RNA甲基化,目前*流行的检测手段为m6A-MeRIP-Seq技术,适用于m6A RNA甲基化谱研究,快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m6A测序:
  •  m6A 全转录组测序(涵盖mRNA,LncRNA,circRNA)
  •  m6A  LncRNA测序(涵盖LncRNA和mRNA)
  •  m6A  Pri-miRNA测序(涵盖Pri-miRNA和mRNA)
  •  m6A  mRNA测序
  •  m6A  miRNA测序
02 检测整体m6A RNA修饰水平
LC-MS/MS检测整体RNA修饰水平
*高高效,可以实现一次检测,9类修饰水平检测,一步到位。
比色法检测整体RNA修饰水平
快速检测m6A整体甲基化水平
03 m6A RNA修饰上游酶的筛选
m6A RNA修饰相关酶PCR芯片
寻找上游直接调控m6A RNA甲基化的甲基转移酶。
04 m6A RNA修饰靶基因验证
MeRIP-qPCR
云序提供各类不同修饰的meRIP-qPCR服务,可针对mRNA,lncRNA,环状RNA等不同类型的RNA分子进行检测,低通量验证RNA修饰靶基因表达水平。
05机制互作研究
5.1 RIP-seq/qPCR
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制。
5.2 RNA pull down -MS/WB
筛选或验证目标RNA互作基因或蛋白,研究相应的分子调控机制。
5.3 双荧光素酶实验
验证两基因互作,研究相应的分子调控机制。
5.4ChIP-seq
筛选或验证目标蛋白与DNA互作,研究相应的分子调控机制。

云序生物服务优势

优势一:发表10分以上文章*多的m6A RNA甲基化测序服务平台。云序已累计支持客户发表52+篇高水平文章,合计影响因子450分+,是国内支持发文*多、累计影响因子*高的公司。
优势二:至今完成4000+例 m6A测序样本,全mian覆盖医口、农口等各类样本。
优势三:全mian检测mRNA和各类非编码RNA(circRNA,lncRNA,Pri-miRNA等)。
优势四:du家提供m6A一站式服务:m6A整体水平检测m6A测序MeRIP-qPCR验证RIPRNA pull-down等。
优势五:率先研发超微量MeRIP测序技术,RNA量低至500ng起。
优势六:国内*全的RNA修饰测序平台,提供m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、O8G、ac4C乙酰化和2'-O-甲基化测序。
 
云序客户m6A RNA修饰部分文章列表

客户文章列表.png


相关产品
m5C RNA甲基化测序
m1A RNA甲基化测序
m7G RNA甲基化测序
ac4C RNA乙酰化测序
O8G RNA氧化修饰测序
2’-O-RNA甲基化测序
m6Am RNA甲基化测序

 
往期回顾
1区 IF: 21|云序MeRIP-Seq & RIP-Seq助力肺动脉高压中m6A阅读蛋白YTHDF1机制研究
云序生物*新“RNA”甲基化研究汇总——m6A修饰之植物篇
云序项目文章纯测序发表7分杂志|西北农林猪精子m6A修饰文章
项目文章|赫捷院士团队揭密肺腺* m6A 机制再次登上Nature 子刊!
项目文章|赫捷院士团队nature子刊揭示METTL3以m6A依赖方式调控食管鳞*
农口方向3个月内搞定5分文章秘籍——m6A热点错不了
m6A项目文章|ALKBH5通过调控WNT5A稳定性促进缺血后血管生成
3-5月 m6A RNA甲基化影响因子10+文章集锦
云序客户再发15分文章:FBW7靶向m6A结合蛋白YTHDF2抑制卵巢*
Science新发现 |RNA以m6A依赖方式调节染色质状态和基因转录
m6A 10分+文章思路干货视频
Nat Commun | 云序客户揭示Mettl3协调*症的生长和转移的分子机制
项目文章|m6A甲基化修饰对神经退行性疾病的重大发现
云序客户余健秀课题组m6A方向再次取得重大发现——SUMO化促进YTHDF2结合m6A修饰的mRNA影响**进展
一次RNA甲基化测序,多项成果|云序测序带您超高性价比体验
2020年整年度RNA甲基化文献汇总
9-11月 m6A RNA甲基化影响因子10+文章集锦
项目文章|Nature子刊m6A修饰携手miRNA揭示脱氧胆酸在胆囊*中作用机制
云序超微量MeRIP测序技术助力用户m6A甲基化文章连续发表
m1A多篇齐发:除了m6A,还有哪些热门RNA修饰?
云序客户**成果揭秘:三个月内搞定5分m6A甲基化谱文章?
8月m6A RNA甲基化影响因子10+文章集锦
20分Nature子刊|揭秘神经发育过程中m6A RNA甲基化与组蛋白修饰间的关系
去甲基化酶ALKBH5在胰腺*中的作用荣登15分杂志
国自然热点—m6A等热门RNA修饰研究技术漫谈
                                                                     




sT7nA3zl15svQDLy+3M2/4g+oI4b0q944OBNIdkpjVQPqQgC0ShgMxEOBXa7ghNTDrkcvYSGkDUhEst5qpmoNCEfY3rC5w6ZTXDreTu/j4TzYLmu8nfh8FfNA5Y/ft1p