欢迎进入上海云序生物科技有限公司官方网站!   生物在线    丁香通

服务热线 021-64878766

首页 > 新闻动态 > 行业新闻

什么是环状RNA测序
日期:2019年05月30日    来源:http://www.cloud-seq.com.cn

环状RNA测序是一类特殊的非编码RNA分子,也是RNA领域新的研究热点。与传统的线性RNA(linear RNA,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。

一些circRNA富含microRNA(miRNA)反应元件(microRNAresponse element, MRE),可扮演竞争性内源RNA(competingendogenous RNA)角色,可与miRNA结合,在细胞内发挥miRNA海绵的作用,抑制miRNA发挥功能从而调节基因表达水平。环状RNA还具有时空特异性与进化上的保守性,这些特点显示circRNA在转录水平与转录后水平可能发挥着重要作用。

环状RNA测序应用领域

肿瘤等疾病致病机理的研究;

生长发育过程中的基因表达调控变化;

其他关心基因转录表达调控的研究方向。

环状RNA测序分析内容

1.  测序评估: 测序质量评估、碱基组成与质量分析、过滤信息统计

2.  环状RNA鉴定统计 :统计Reads类型 、环状RNA类型 、环状RNA分布

3. 来源基因富集分析

4.  表达量计算与差异分析:表达量计算 、样品比较 、比较组差异表达分析

5.  数据库注释与靶向预测:已存在环状RNA与新预测环状RNA、环状RNA与小RNA靶向关系鉴定与预测

6.  circRNAs-miRNAs-mRNAs关联分析

l2iskDVmZEmm5SuoLqE4IIg+oI4b0q944OBNIdkpjVRWPkBwznGp84FaRie+1ZcAJHyDicb4f5esbC8EfN5zApW7lchXs53FDG3naElOOQhnGd0A8++mwv612/XkxIZD